Стиль бонсай разделяют на несколько видов: токкан, хокидачи, сокан, моеги, кенгай.
Различаются они по форме дерева, расположению и внешнему виду ствола и кроны.
Стиль токкан. Прямостоящее дерево с ровным вертикальным стволом и треугольной кроной. Крепкие, хорошо вросшие в землю корни, разбросанные по всем сторонам вокруг дерева, создают небрежный, основательный вид. Стиль токкан больше всего подходит при выращивании хвойных и вечнозеленых деревьев — кипарис, туя, сосна, ель.
Стиль хокидачи. Прямой ствол дерева с метлообразной или веерообразной кроной. Крона занимает 2/3 части растения, на нижней трети ствола дерева ветвей нет. Стиль хокидачи немного проще других стилей в том, что более легко дается и поддерживается форма кроны.
Стиль сокан. Сокан — «дерево, растущее вместе». У основания дерева срастаются и имеют общие корни два ствола. Как правило, это растение имеет два молодых побега, один из которых основной, другой — «придаточный». Он меньше, тоньше и немного отклонен в сторону. Стиль сокан подходит для плодовых или лиственных деревьев.
Стиль моеги. Стиль моеги определяет «свободное прямое» дерево. Ствол может быть немного изогнутым, слегка наклоненным в одну или другую сторону, но вершина дерева должна быть расположена точно над тем местом, где находится его основание. В этом стиле небольшой изгиб ствола приходится на его нижнюю часть.
Стиль кенгай. Кенгай означает «каскад», «поток». Ствол и ветви растения направлены вниз и создают вид растущего на скале дерева. Для бонсай этого стиля наиболее всего подходят деревья, растущие в природе в экстремальных условиях (на скалах) и подвергающиеся воздействию сильных ветров или камнепадам. Можно использовать для выращивания сосну, можжевельник.